这部动画将呈现路飞十年前与香克斯的约定，以及由此开启伟大冒险的路飞与索隆、娜美、乌索普、山治的相遇和他们成为同伴的点点滴滴，这些令人难忘的场景将悉数呈现！路飞与乔巴、罗宾、弗兰奇、布鲁克五人相遇时，他们正在做什么呢？！原作漫画封面插图的一部分将在片尾字幕中首次动画化！

在前往新世界的路上，草帽海贼团的各位悠哉游哉，举行了盛大豪华的时装秀。而就在此时，他们遭到比利奇准将所率领的海军的袭击，借着约瑟芬大炮的威力，草帽海贼团的船飞到了一座未知的小岛——手之岛。该岛形状像一只摊开的手掌，并且上面云集了来自全世界的能工巧匠。他们所制作出的手工艺品得到路飞、乌索普、布鲁克等人大为欣赏，但是手工艺品却十分短缺。因为这里的壮丁都被比利奇准将拉去修建海军基地，饱受压迫。路飞意外邂逅了雕蜡工匠杰高，既勾起了他童年的记忆，也知晓了手之岛的往事。比利奇准将不断膨胀的野心，必将为这座小岛带来一场前所未有的暴风雨……

故事发生在大阪的舞户学园，小泉理沙（冈村明美 配音）是一个身高170的“女巨人”，经常因为身高而被嘲笑的她在潜移默化之中担负起了搞笑的重任。无巧不成书，和理沙相对应的，同校的大谷敦士（永田彬 配音）是一个个头只有156的“矮冬瓜”，这一高一矮的两人不是冤家不聚头，在一 唱一和中，居然称为了校园之中的著名搞笑组合。　　其实理沙和大谷之间的感情并不坏，两人甚至还有着共同的爱好——均是“海坊主”的粉丝。在出双入对的同时，他们的距离也越来越近，在好友石原信子（东纱织 配音）和中尾平吉（津田健次郎 配音）的撮合下，终成眷属，一段校园爱情佳话成为传奇。

拥有28万人口的三门市，其境内某天突然打开了一扇通往未知世界的大门。从大门的另一端，被称为“近界民”的怪物蜂拥而出。人类惊慌失措之余发现，地球现有的武器对近界民完全没有任何效果。危急时刻，神秘团体境界防卫组织“BORDER”出现击退近界民，三门市总算回归往昔的正常生活。如是过了四年半的时间，隐藏着作为“BORDER”成员身份的初中学生三云修（梶裕贵 配音）和转学生空闲游真（村中知 配音）相遇，而对方竟然是来自门另一头的近界民，此行的目的是为了找到自己的父亲。分出不同阵营的二人，注定要在命运的战争中激烈碰撞……　　本片根据苇原大介的同名漫画改编。